Het is het jaar 2070. Een enorm object verschijnt aan de hemel van Tokio en veroorzaakt verwarring. De UFO wordt plotseling vernietigd door een ander enorm object dat verdwijnt. De regering geeft vervolgens het bestaan van buitenaardse wezens toe. Een paar dagen later arriveert de vreemde Muryo Subaru op de Misumaru Middle School en raakt bevriend met Hajime Murata. Terwijl Muryo betrokken raakt bij kleine ruzies tussen de raden van afgevaardigden in dit college, verzamelen vreemde mensen met bovennatuurlijke krachten zich in dit college en lijken ze verbonden te zijn met de verschillende UFO's die we zien.