Flay, die von Rau gefangen gehalten wurde, wird in eine Rettungskapsel gesteckt und erhält eine Diskette, die die Daten des Neutron Jammer Canceller enthält. Flay gelingt es, zur Dominion und zur Archangel durchzudringen. Kira hört dies ebenfalls und eilt zu ihrer Rettung, lässt sich aber unbewacht zurück, und den Freedom wird in den Kopf geschossen. Athrun rettet den Freedom und bringt sie zurück zur Archangel. In der Zwischenzeit rettet die Dominion Flay und ermöglicht es Muruta Azreal, sein ursprüngliches Ziel zu erreichen. Zurück im Eternal wird Kira bewusstlos. Als er erwacht, trösten ihn seine Freunde und Lacus, während er seinen ganzen mentalen Stress abbaut.